Τι συνέβη και το πέμπτο μεγαλύτερο κύμα της πανδημίας του κορoναϊού στην Ιαπωνία εξαφανίστηκε;

medlabnews.gr iatrikanea

H μετάλλαξη Δέλτα φέρεται να «αυτο-εξαφανίστηκε»... Άλλοι πιθανοί παράγοντες ελάττωσης είναι οι εμβολιασμοί, τα μέτρα κοινωνικής αποστασιοποίησης, η καραντίνα και η χρήσης μάσκας.

Γιατί το πέμπτο και μεγαλύτερο κύμα της πανδημίας του κορoναϊού στην Ιαπωνία, που προκλήθηκε από την υπερσυμβατική μετάλλαξη Δέλτα, ξαφνικά σταμάτησε μετά από μια φαινομενικά αδυσώπητη αύξηση των νέων λοιμώξεων;

Τι έκανε άραγε την Ιαπωνία διαφορετική από άλλες ανεπτυγμένες χώρες που βλέπουν τώρα μια αύξηση των νέων κρουσμάτων; Σύμφωνα με μια ομάδα ερευνητών, η απάντηση μπορεί να είναι ότι η μετάλλαξη Δέλτα "αυτο-εξαφανίστηκε".

Στα μέσα Αυγούστου, η Ιαπωνία σημείωσε κορύφωση των κρουσμάτων Covid-19, καταγράφοντας πάνω από 23.000 νέα κρούσματα την ημέρα. Τώρα η μέτρηση είναι περίπου 170, με τους θανάτους που αποδίδονται στη νόσο να παραμένουν ως επί το πλείστον μονοψήφιοι αυτόν τον μήνα.

Αξίζει να σημειωθεί πως δεν αναφέρθηκαν θάνατοι στις 7 Νοεμβρίου και είναι η πρώτη φορά που συνέβη αυτό εδώ και περίπου 15 μήνες.

Πολλοί μελετητές επισημαίνουν αρκετούς λόγους, μεταξύ αυτών και ότι στην Ιαπωνία υπάρχει ένα από τα υψηλότερα ποσοστά εμβολιασμού μεταξύ των προηγμένων χωρών με το 75,7% των κατοίκων να έχουν εμβολιαστεί πλήρως.

Άλλοι πιθανοί παράγοντες είναι τα μέτρα κοινωνικής αποστασιοποίησης και η χρήσης μάσκας, τα οποία είναι πλέον βαθιά ενσωματωμένα στην ιαπωνική κοινωνία.

Αλλά ο κύριος λόγος μπορεί να σχετίζεται με τις γενετικές αλλαγές που υφίσταται ο κορονοϊός κατά τη διάρκεια της αναπαραγωγής, με ρυθμό δύο μεταλλάξεων περίπου τον μήνα. Σύμφωνα με μια επαναστατική θεωρία που προτάθηκε από τον Ituro Inoue, καθηγητή στο Εθνικό Ινστιτούτο Γενετικής, η μετάλλαξη Δέλτα στην Ιαπωνία συγκέντρωσε πάρα πολλές μεταλλάξεις στη διόρθωση σφαλμάτων του ιού, τη μη δομική πρωτεΐνη που ονομάζεται nsp14.

Ως αποτέλεσμα, ο ιός αγωνίστηκε να επιδιορθώσει τα σφάλματα εγκαίρως, και οδηγήθηκε τελικώς σε «αυτοκαταστροφή».

Μελέτες έχουν δείξει ότι οι περισσότεροι άνθρωποι στην Ασία έχουν ένα αμυντικό ένζυμο που ονομάζεται APOBEC3A που επιτίθεται σε ιούς RNA, συμπεριλαμβανομένου του ιού SARS-CoV-2, ο οποίος προκαλεί τη COVID-19, σε σύγκριση με τους ανθρώπους στην Ευρώπη και την Αφρική.

Έτσι, οι ερευνητές από το Εθνικό Ινστιτούτο Γενετικής και το Πανεπιστήμιο Niigata μελέτησαν πώς η πρωτεΐνη APOBEC3A επηρεάζει την πρωτεΐνη nsp14 και αν μπορεί να εμποδίσει τη δραστηριότητα του κορονοϊού.

Η ομάδα διεξήγαγε ανάλυση των δεδομένων γενετικής ποικιλομορφίας για τις μεταλλάξεις Άλφα και Δέλτα από μολυσμένα κλινικά δείγματα στην Ιαπωνία από τον Ιούνιο έως τον Οκτώβριο. Στη συνέχεια, οπτικοποίησαν την αλληλουχία DNA του ιού SARS-CoV-2 για να δείξουν γενετική ποικιλομορφία σε ένα διάγραμμα που ονομάζεται δίκτυο απλοτύπων.

Σε γενικές γραμμές, όσο μεγαλύτερο είναι το δίκτυο, τόσο πιο θετικές περιπτώσεις αντιπροσωπεύει, αναφέρει δημοσίευμα της ιστοσελίδας japantimes.

Το δίκτυο της μετάλλαξης Άλφα, το οποίο ήταν ο κύριος οδηγός για το τέταρτο κύμα της Ιαπωνίας από τον Μάρτιο έως τον Ιούνιο, είχε πέντε μεγάλες ομάδες με πολλές μεταλλάξεις να διακλαδώνεται, επιβεβαιώνοντας ένα υψηλό επίπεδο γενετικής ποικιλομορφίας.

«Ο ιός δεν ήταν πλέον σε θέση να "αντιγράψει" τον εαυτό του»

Οι ερευνητές πίστευαν ότι η μετάλλαξη Δέλτα, η οποία τα Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων των ΗΠΑ λένε ότι είναι υπερδιπλάσια μεταδοτική από τις προηγούμενες παραλλαγές και μπορεί να προκαλέσει πιο σοβαρή ασθένεια σε ανεμβολίαστους ανθρώπους, θα είχε μια πολύ πιο ζωντανή γενετική ποικιλομορφία.

Παραδόξως, ανακάλυψαν ότι αληθεύει το αντίθετο. Το δίκτυο απλοτύπων είχε μόνο δύο μεγάλες ομάδες και οι μεταλλάξεις φαινόταν να σταματούν ξαφνικά στη μέση της εξελικτικής διαδικασίας ανάπτυξής του.

Όταν οι ερευνητές συνέχισαν να εξετάζουν το ένζυμο διόρθωσης σφαλμάτων του ιού nsp14, ανακάλυψαν ότι η συντριπτική πλειοψηφία των δειγμάτων nsp14 στην Ιαπωνία φαινόταν να έχει υποστεί πολλές γενετικές αλλαγές σε περιοχές μετάλλαξης που ονομάζονται A394V.

«Ήμασταν κυριολεκτικά συγκλονισμένοι όταν είδαμε τα ευρήματα» δήλωσε ο Inoue, στους Japan Times.

«Η μετάλλαξη Δέλτα στην Ιαπωνία ήταν ιδιαίτερα μεταδοτική διατηρώντας, επίσης, άλλες παραλλαγές. Αλλά καθώς οι μεταλλάξεις συσσωρεύονταν, πιστεύουμε ότι τελικά εξελίχθηκε σε έναν ελαττωματικό ιό, ο οποίος δεν ήταν πλέον σε θέση να "αντιγράψει" τον εαυτό του. Λαμβάνοντας υπόψη ότι τα κρούσματα δεν έχουν αυξηθεί, πιστεύουμε ότι σε κάποιο σημείο κατά τη διάρκεια τέτοιων μεταλλάξεων οδηγήθηκε κατευθείαν προς τη φυσική εξαφάνισή του».

Η θεωρία του Inoue, αν και καινοτόμος, υποστηρίζει τη μυστηριώδη εξαφάνιση της εξάπλωσης της μετάλλαξης Δέλτα στην Ιαπωνία.

Ενώ μεγάλο μέρος του υπόλοιπου κόσμου με παρόμοια υψηλά ποσοστά εμβολιασμού, συμπεριλαμβανομένης της Νότιας Κορέας και ορισμένων δυτικών χωρών, υποφέρουν από πρωτοφανή κύματα νέων λοιμώξεων, η Ιαπωνία φαίνεται να είναι μια ιδιόμορφη περίπτωση καθώς τα κρούσματα της COVID-19 παρέμειναν υποτονικά.

«Εάν ο ιός ήταν ζωντανός και καλά, τα κρούσματα σίγουρα θα αυξάνονταν καθώς η χρήση μάσκας και ο εμβολιασμός δεν εμποδίζουν σημαντικές λοιμώξεις σε ορισμένες περιπτώσεις» δήλωσε ο Inoue. Πράγματι, η απροσδόκητη πτώση των νέων κρουσμάτων μετά το καλοκαιρινό κύμα υπήρξε ένα καυτό θέμα συζήτησης μεταξύ πολλών ειδικών, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που δεν διεξάγουν μελέτες για τον κορονοϊό, σύμφωνα με τον Takeshi Urano, καθηγητή στην Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Shimane, ο οποίος δεν συμμετείχε στην έρευνα υπό την ηγεσία του Inoue.

Η μετάλλαξη Δ απέκλειε την... Α

«Ο Nsp14 λειτουργεί με άλλες πρωτεΐνες του ιού και έχει μια κρίσιμη λειτουργία για την προστασία του ιού RNA από τη διάσπαση» είπε όταν ρωτήθηκε για τα ευρήματα του Inoue. «Μελέτες έχουν δείξει ότι ένας ιός με σακατεμένο nsp14 έχει σημαντικά μειωμένη ικανότητα αναπαραγωγής, οπότε αυτό μπορεί να είναι ένας παράγοντας πίσω από την ταχεία μείωση των νέων περιπτώσεων. Το nsp14 προέρχεται από ιούς και ο χημικός παράγοντας για τον περιορισμό αυτής της πρωτεΐνης θα μπορούσε να γίνει ένα πολλά υποσχόμενο φάρμακο, με την έρευνα να βρίσκεται ήδη σε εξέλιξη».

Η Ιαπωνία είναι η μοναδική χώρα που η παραλλαγή Δέλτα ουσιαστικά απέκλειε τη μετάλλαξη Άλφα και άλλες μεταλλάξεις μέχρι τα τέλη Αυγούστου.

Στον αντίποδα, άλλες χώρες —συμπεριλαμβανομένης της Ινδίας και της Ινδονησίας, οι οποίες επλήγησαν ιδιαίτερα σκληρά από τη μετάλλαξη Δέλτα— ανέφεραν ένα μείγμα στελεχών Άλφα και Δέλτα μεταξύ των περιπτώσεων.

Μια παρόμοια φυσική εξαφάνιση του κορονοϊού θα μπορούσε ενδεχομένως να παρατηρηθεί στο εξωτερικό, λέει ο Inoue, προσθέτοντας ότι η ανίχνευσή του θα ήταν δύσκολη καθώς καμία άλλη χώρα δεν φαίνεται να έχει συσσωρεύσει τόσες μεταλλάξεις στο nsp14 του ιού όπως στην Ιαπωνία. Αν και παρόμοιες μεταλλάξεις στην τοποθεσία A394V έχουν ανακαλυφθεί σε τουλάχιστον 24 χώρες. Η θεωρία του Inoue μπορεί επίσης να βοηθήσει να δοθούν απαντήσεις γιατί το ξέσπασμα του σοβαρού αναπνευστικού συνδρόμου (SARS) τελείωσε απότομα το 2003.

Ένα πείραμα στο οποίο οι ερευνητές προκάλεσαν μεταλλάξεις στο nsp14, στον ιό που προκαλεί το SARS, οδήγησε σε ευρήματα ότι ο ιός τελικά δεν μπορούσε να αναπαραχθεί καθώς συσσωρεύονταν μεταλλάξεις.

Μπορεί να δούμε παρόμοια φυσική εξαφάνιση;

«Οι πιθανότητες δεν είναι μηδενικές, ωστόσο αυτό φαίνεται πολύ αισιόδοξο προς το παρόν, καθώς δεν είμαστε σε θέση να βρούμε τέτοια στοιχεία, αν και έχουμε εξετάσει διάφορα δεδομένα άλλων χωρών» ανέφερε.

Από την κορύφωση στα μέσα Αυγούστου, τα ημερήσια κρούσματα της COVID-19 στην Ιαπωνία συνέχισαν μια πτωτική πορεία κάτω από 5.000 άτομα μέχρι τα μέσα Σεπτεμβρίου και κάτω από 200 μέχρι τα τέλη Οκτωβρίου.

Η χώρα απολαμβάνει ένα από τα χαμηλότερα ποσοστά μόλυνσης από οποιαδήποτε προηγμένη χώρα εδώ και αρκετό καιρό, αλλά δεν είναι απρόσβλητη από το επόμενο κύμα της πανδημίας, λέει ο Inoue.

«Υπάρχει σαφώς απειλή» ανέφερε. «Ήμασταν εντάξει επειδή υπήρχε η μετάλλαξη Δέλτα. Άλλες παραλλαγές "τρύπωναν" σιγά-σιγά, αλλά η Δέλτα στην Ιαπωνία τους κρατούσε μακριά. Αλλά επειδή τώρα δεν υπάρχει τίποτα για να τους κρατήσει μακριά, δημιουργήθηκε χώρος για νέους να εισέλθουν, καθώς τα εμβόλια από μόνα τους δεν θα λύσουν το πρόβλημα. Με αυτή την έννοια, πιστεύω ότι τα μέτρα καραντίνας για τον έλεγχο της εξάπλωσης είναι πολύ σημαντικά, καθώς ποτέ δεν γνωρίζουμε τι έρχεται από ξένες χώρες». Μερικοί άνθρωποι μπορεί να αναρωτιούνται αν η αυτο-εξαφάνιση της μετάλλαξης Δέλτα στην Ιαπωνία προκλήθηκε από κάτι ιδιαίτερο στον γενετικό κώδικα του ιαπωνικού λαού, αλλά ο Inoue διαφωνεί.

«Δεν το νομίζω», είπε. «Οι άνθρωποι στην Ανατολική Ασία, όπως οι Κορεάτες, είναι εθνοτικά ίδιοι με τους Ιάπωνες. Δεν ξέρω γιατί συνέβη αυτό στην Ιαπωνία».

Ο Inoue ανέφερε ότι η ομάδα ερευνητών του Εθνικού Ινστιτούτου Γενετικής και του Πανεπιστημίου Νιιγκάτα σκοπεύει να συντάξει μελέτη για τα ευρήματά τους μέχρι τα τέλη Νοεμβρίου.

Πηγή japantimes.co.jp